Το Μικροβιολογικό Εργαστήριο της SOS MEDICAL ASSISTANCE  είναι πλήρως εξοπλισμένο με τελευταίας γενιάς αναλυτές που καλύπτουν όλο το φάσμα των διαγνωστικών αναλύσεων και των καλλιεργειών. Για τη διασφάλιση της ποιότητας των αποτελεσμάτων του, το Εργαστήριο συμμετέχει σε διεθνή προγράμματα εξωτερικού ποιοτικού ελέγχου (External Quality Control) των αναλύσεών του. Το τμήμα λειτουργεί όλο το 24ωρο για την κάλυψη των αναγκών όλων  των ασθενών.